Zavod za voćarstvo utemeljen je 2006. godine na 78. sjednici Fakultetskog vijeća. Od samog utemeljenja, u sklopu različitih kolegija na preddiplomskom i diplomskom sveučilišnom studiju Agronomije, Zavod izvodi nastavu unutar različitih disciplina znanstvenih grana bilinogojstva i voćarstva. Posebna pozornost u aktivnostima Zavoda posvećuje se stvaranju materijalnih i kadrovskih pretpostavki za nesmetano i kvalitetno odvijanje nastavnog procesa i drugih sadržaja vezanih uz zadatke Fakulteta. Zavod podupire i razvija znanstveni rad na istraživanju bioloških i gospodarskih osobina vrsta, sorata i podloga voćaka, pomoekološkim istraživanjima i utvrđivanju skladišne sposobnosti voća. Djelatnici Zavoda pružaju i savjetodavne usluge u okviru voćarske proizvodnje i rasadničarstva, pri planiranju i podizanju voćnjaka, uzgoju i njezi voćnjaka te berbi i skladištenju ubranih plodova, a svoj doprinos daju i tijelima javne uprave na svim razinama vezano uz izradu zakonskih i podzakonskih propisa iz oblasti bilinogojstva i voćarstva.